基于云計算的蛋白質折疊空間結構預測
所屬分類：技術論文
上傳者：wwei
文檔大?。?span>3619 K
標簽： 云計算 蛋白質折疊 空間結構預測
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文檔介紹：構建基于云計算的蛋白質折疊空間結構預測框架，通過數據云存儲設備獲取蛋白質序列原始數據，采用HDFS（Hadoop Distributed File System）分布式存儲方式保存于云端。資源和隊列管理器RQM（Resource Queue Management）開啟云端虛擬機后，以之作為掃描節(jié)點（Sensor Node， SN），SN基于二維AB非格點模型建立最小蛋白質分子能量優(yōu)化函數，采用局部搜索機制改進的量子遺傳算法對其作優(yōu)化求解。利用云端GPU設備處理模型訓練數據，即可實現蛋白質折疊空間結構的自動化預測。實驗結果表明：蛋白質序列能量勢函數計算結果更小、執(zhí)行效率更高、GDT-TS（Geothermal Development and Testing Tool Suite）評價指標值更大。
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